会议要求着力破解五大难题，即：破解科研工作与现代农业发展不协调的难题；破解实力、活力、竞争力不强的难题；破解人才支撑与科研工作整体现状不相适应的难题；破解封闭保守、因循守旧与现代农业发展不相适应的难题；破解办事效率不高、拈轻怕重与农科院跨越式发展不相适应的难题。通过破解这些难题，为农科院“二次创业，再铸辉煌”提供强大的科学支撑。会议还提出要按照科学发展的要求推动当前各项工作顺利开展。